종사업장번호를 입력하지 않아도 가산세 대상이 되지는 않습니다. 다만, 거래처에서 부가가치세 신고 시 사업장별 과세표준 및 납부세액 명세서를 작성할 때 편의를 위해 각 사업장별로 계산하는 데 어려움이 있을 수 있습니다.
종사업장번호는 사업자단위과세자가 여러 사업장을 운영할 때 각 지점을 구분하기 위해 부여받는 번호입니다. 홈택스에서 전자세금계산서를 발급할 때, 사업자등록번호 입력 후 해당 종사업장(지점)을 선택하면 종사업장번호가 자동으로 표시됩니다. 만약 종사업장 중 폐업한 사업장이 있다면 해당 사업장의 종사업장번호는 더 이상 사용되지 않습니다.