네, 종합소득세 신고 시 공제받고 싶지 않은 항목은 체크하지 않으셔도 됩니다. 국세청 홈택스에서 제공하는 종합소득세 신고 화면에서는 다양한 공제 항목들이 제시되며, 납세자 본인이 해당 항목의 공제를 받고자 할 경우에만 선택적으로 체크하여 반영하게 됩니다.
따라서, 특정 공제 항목을 적용받고 싶지 않으시다면 해당 항목을 선택하지 않으시면 됩니다. 이는 납세자의 선택권을 존중하고, 본인의 상황에 맞게 세금 신고를 할 수 있도록 하기 위함입니다. 다만, 공제받지 않음으로써 세금 부담이 늘어날 수 있으니 신중하게 결정하시는 것이 좋습니다.