확정신고까지 마친 상태에서 공급자가 부가가치세 별도 항목을 근거로 추가 부가가치세를 요구하는 경우, 계약서 및 세금계산서 등 거래 증빙을 면밀히 검토해야 합니다. 계약서에 부가가치세 별도 지급에 대한 명확한 약정이 있는지, 세금계산서에 부가가치세가 별도로 기재되어 있는지 확인하는 것이 중요합니다.
만약 계약서에 부가가치세 별도 지급 약정이 명확히 없고, 세금계산서에도 부가가치세가 포함된 총액으로 기재되어 있다면, 공급자의 추가 요구는 부당할 수 있습니다. 이 경우, 이미 확정신고를 마쳤으므로 추가 납부 의무는 없을 가능성이 높습니다. 그러나 공급자가 계약서 해석이나 세금계산서 발급 시점 등을 근거로 추가 부가가치세를 주장한다면, 법률 전문가와 상담하여 정확한 사실관계를 파악하고 대응 방안을 모색하는 것이 좋습니다.
특히, 공급자가 주장하는 부가가치세 별도 항목이 계약서나 세금계산서에 명확히 기재되지 않았거나, 공급 시기 등과 관련하여 법적 다툼의 소지가 있다면, 임의로 추가 부가가치세를 지급하기보다는 전문가의 조언을 구하는 것이 현명합니다.