세무조사 시 특수관계회사 관련 법규 조사를 받게 되면 어떻게 되나요?

세무조사 시 특수관계회사 관련 법규 조사를 받게 되면, 해당 거래가 조세 부담을 부당하게 감소시킨 것으로 인정될 경우 법인의 소득금액이 재계산될 수 있습니다. 이는 주로 다음과 같은 경우에 해당합니다.

1. 부당행위계산 부인: 특수관계자와의 거래에서 자산을 시가보다 비싸게 매입하거나 싸게 양도하는 경우, 무상 또는 저리로 금전을 대여하거나 용역을 제공하는 경우 등이 해당됩니다. 이 경우 시가에 따라 과세될 수 있습니다.
2. 공동경비 안분: 특수관계 법인 간 공동으로 발생한 비용을 매출액 비율이나 자산가액 비율 등으로 적정하게 안분하지 않으면, 해당 비용이 부인될 수 있습니다.

이러한 조사를 받게 되면, 거래의 실제 용역 제공 사실을 입증할 수 있는 객관적인 자료(업무 대화 내역, 이메일, 회의록 등)와 거래 대가가 시가에 부합함을 입증할 수 있는 자료(제3자 거래 사례, 감정평가 등)를 철저히 준비해야 합니다. 또한, 공동경비 배분 기준을 문서화하고 일관되게 적용하는 것이 중요합니다. 이러한 준비가 미흡할 경우, 비용 부인에 따른 세 부담 증가 및 가산세 부과로 이어질 수 있습니다.

세무조사는 조세 회피 여부를 확인하고 적정 세금 신고를 유도하는 절차이지만, 특수관계자 거래는 과세관청의 주요 검토 대상이므로 철저한 대비가 필요합니다.