도매 소매업을 운영 중인데, 제약 구매 시 매입세액 공제 가능한 항목과 불가능한 항목은 무엇인가요?
도매 소매업을 운영 중인데, 제약 구매 시 매입세액 공제 가능한 항목과 불가능한 항목은 무엇인가요?
2026. 5. 6.
도매 및 소매업을 운영하시면서 의약품 구매 시 매입세액 공제 가능 여부는 해당 의약품의 사용 목적에 따라 달라집니다.
매입세액 공제 가능한 항목:
일반의약품 판매 목적 구매: 사업자가 일반의약품을 판매하기 위해 구매하는 경우, 해당 구매에 대한 부가가치세는 매입세액으로 공제받을 수 있습니다. 이 경우 적격 증빙(세금계산서, 신용카드 매출전표 등)을 수취해야 합니다.
매입세액 공제 불가능한 항목:
조제용 의약품 구매: 약국에서 조제용으로 사용되는 의약품 구매 시 부담한 부가가치세는 매입세액 공제가 불가능합니다. 이는 조제 행위가 부가가치세 면세 대상이기 때문입니다.
면세 사업 관련 구매: 사업자등록증상 도소매업으로 되어 있더라도, 면세되는 재화나 용역을 공급하기 위한 목적으로 구매한 경우에는 매입세액 공제가 제한될 수 있습니다. (예: 면세 농산물 등을 원재료로 하여 단순 가공 후 판매하는 경우 등)
참고 사항:
사업자등록 전 지출한 비용의 경우, 사업자등록 신청 기한 준수 및 사업 관련성, 적격 증빙(주민등록번호 기재 세금계산서 등) 수취 요건을 충족하면 매입세액 공제가 가능할 수 있습니다.
의제매입세액 공제는 주로 제조업이나 음식점업 등에서 면세 농산물 등을 원재료로 사용하여 과세 재화를 제조·가공하는 경우에 적용되는 제도로, 단순 도소매업에서는 적용이 제한적입니다. 다만, 사업자등록증상 '식육.식품가공' 업종이 포함되어 있고 실제 가공 후 소포장 판매하는 경우라면 의제매입세액 공제가 가능할 수 있으며, 이 경우 사업자로부터 계산서 등을 수취해야 합니다.
정확한 공제 가능 여부는 실제 거래 내역과 증빙 서류를 바탕으로 판단해야 하므로, 세무 전문가와 상담하시는 것을 권장합니다.