과세전적부심사 결정에는 납세자의 주장 및 입증, 과세관청의 과세 근거, 국세심사위원회의 심의, 관련 법령 및 판례 등 다양한 요인이 영향을 미칩니다. 특히 국세심사위원회는 내부 위원과 외부 전문가로 구성되어 납세자와 과세관청의 주장을 종합적으로 검토하고 심의하여 결정하게 됩니다. 따라서 위원회의 전문성과 공정성이 결정에 중요한 영향을 미칩니다.
과세전적부심사는 납세자의 권리를 보호하고 과세의 적정성을 사전에 검토하는 제도이므로, 납세자의 적극적인 소명과 입증, 그리고 과세관청의 합리적인 과세 근거 제시가 모두 중요하게 작용합니다.