보증보험 가입 시 보증금액을 부가가치세 포함으로 설정하지 않으면, 임대보증금으로 임대료를 상계 처리할 때 간주임대료 계산 시 문제가 발생할 수 있습니다. 특히, 미납 임대료를 보증금에서 차감하는 경우 차감 후 잔액을 기준으로 간주임대료를 계산해야 하는데, 부가가치세가 포함되지 않으면 정확한 계산이 어려워집니다.