원천징수이행상황신고서를 이미 제출했고 신고한 근로소득세액이 맞다면, 홈택스에서 원천세 미납분을 자진납부하시면 됩니다. 납부서 기한이 지났다는 이유만으로 신고서를 다시 제출할 필요는 없습니다.
신고한 세액 자체가 틀렸거나 원천징수이행상황신고서를 제출하지 않았다면, 자진납부만으로 신고 오류나 누락이 해결되는 것은 아니므로 수정신고 또는 기한 후 신고를 먼저 검토해야 합니다. 또한 소득세와 별도로 지방소득세 특별징수분을 납부해야 하는 건이라면 그 납부 여부도 따로 확인하셔야 합니다.