공장 매매 시 부가가치세는 건물 부분에만 과세되며, 토지 부분은 면세됩니다. 부가가치세 계산은 계약서에 토지와 건물 가액이 구분되어 있는지 여부에 따라 달라집니다.
계약서에 부가가치세 처리 방법을 명시하지 않으면 매도인이 부가가치세를 부담하게 되므로, 매도인은 '부가세 별도' 또는 '부가세는 매수자 부담'으로 명시하는 것이 유리합니다.