국내 주식형 펀드에서 발생하는 수익 중 국내 주식 매매차익은 세금이 부과되지 않습니다. 하지만 펀드 내에서 발생하는 주식 배당이나 이자 수익 등은 과세 대상이 될 수 있습니다. 해외 주식형 펀드, 채권형 펀드, 원유나 금에 투자하는 펀드 등은 모두 과세 대상입니다.
펀드 과세는 보통 결산일과 환매일에 이루어집니다. 결산 시점에 수익이 발생하면 세금을 미리 납부하게 되며, 이후 환매 시 실제 수익을 지급받을 때 결산일 이후 발생한 이익에 대해서만 과세됩니다. 다만, 결산 시 세금을 납부했더라도 환매 시점에 전체적으로 손실이 발생하더라도 이미 납부한 세금은 돌려받을 수 없습니다. 일부 펀드의 경우 결산 시점에 수익을 정산하지 않고 환매 시점에 전체 투자 기간 동안의 수익에 대해 세금을 부과하도록 정할 수도 있습니다.