투자일임계약에서 발생하는 매매손익 외에 다른 과세 문제로는 주로 평가손익이 있습니다. 평가손익은 계약 기간 중 보유 자산의 가치 변동으로 발생하는 손익을 의미하며, 이는 법인세법상 각 사업연도의 소득금액 계산 시 익금이나 손금에 산입되지 않습니다. 즉, 아직 실현되지 않은 손익으로 보아 과세 대상에서 제외됩니다. 반면, 매매손익은 계약에 따라 실제로 자산을 매매함으로써 발생하는 손익으로, 거래가 발생한 사업연도의 소득금액에 익금 또는 손금으로 산입되어 과세 대상이 됩니다.