스마트스토어에서 발급되는 세금계산서는 판매자가 직접 발행하는 것이 아니라, 네이버가 매출 내역을 집계하여 일정 기준에 따라 자동으로 발행합니다. 따라서 스마트스토어에서 발급되는 세금계산서는 판매 수수료 및 서비스 이용료와 관련된 것으로, 발행 주체에 따라 네이버파이낸셜과 네이버 주식회사가 구분됩니다.
네이버파이낸셜이 발행하는 세금계산서에는 네이버페이 수수료, 판매수수료, 버티컬 사용료, 지정반품 택배비 등이 포함됩니다. 네이버 주식회사가 발행하는 세금계산서에는 쇼핑 서비스 이용료(예: 마케팅 메시지 발송 비용) 및 커머스 솔루션 서비스 이용료(예: 소비자 조사 솔루션) 등이 포함될 수 있습니다.
판매자는 별도로 세금계산서를 작성하거나 발급할 필요 없이, 구매자가 구매확정을 완료한 후 네이버페이 화면에서 조회 및 출력할 수 있습니다. 세금계산서는 매월 1일부터 말일까지 발생한 구매확정 건을 기준으로 다음 달 3영업일 이내에 발행됩니다.