세금계산서에 사업자등록번호가 없을 경우 매입세액 공제는 어떻게 처리하나요?

사업자등록번호가 기재되지 않은 세금계산서의 경우, 원칙적으로 해당 매입세액은 공제받을 수 없습니다. 부가가치세법상 매입세액 공제를 받기 위해서는 적격증빙인 세금계산서에 공급받는 자의 사업자등록번호가 정확하게 기재되어야 하기 때문입니다.

다만, 다음과 같은 예외적인 경우에는 매입세액 공제가 가능할 수 있습니다.

1. 사업자등록 전 거래: 사업자등록을 신청하기 전의 거래에 대해 대표자의 주민등록번호로 세금계산서를 발급받은 경우, 공급시기가 속하는 과세기간 종료 후 20일 이내에 사업자등록을 신청하고 적법한 증빙을 갖춘 경우에 한해 공제가 인정될 수 있습니다.
2. 착오로 인한 기재: 사업자등록을 마친 사업자가 세금계산서 발급 시 착오로 사업자등록번호 대신 대표자의 주민등록번호를 기재한 경우, 거래 사실이 확인되고 추후 사업자등록번호로 수정세금계산서를 발급받는 등의 절차를 거치면 매입세액 공제가 가능할 수 있습니다. 이 경우, 세금계산서의 본질적인 기능을 침해하지 않는 범위 내에서 착오로 인한 것으로 인정되어야 합니다.

따라서, 세금계산서 수취 시에는 반드시 공급받는 자의 사업자등록번호가 정확하게 기재되었는지 확인하는 것이 중요합니다.