근로소득 원천징수 영수증을 납세조합을 통해 받았을 때, 세금 일부를 납부하고 연말정산 시 나머지 세금을 납부하려면 어떻게 신고해야 하나요?

납세조합을 통해 근로소득 원천징수영수증을 받으셨고, 이미 일부 세금을 납부하신 경우 연말정산 시 나머지 세금을 신고하고 납부하는 방법은 다음과 같습니다.

결론: 납세조합을 통해 연말정산을 진행하며, 이미 납부한 세액을 공제받고 나머지 세액을 납부하게 됩니다. 납세조합은 근로소득자의 소득 및 세액공제 신고 내용을 바탕으로 종합소득 산출세액을 계산하고, 관련 세액공제 및 이미 원천징수된 세액을 공제한 후 최종 납부할 세액을 원천징수합니다.

근거:

1. 납세조합의 연말정산 의무: 납세조합은 가입한 근로소득자의 연말정산을 대행합니다. 종합소득공제를 적용한 후 종합소득과세표준을 계산하고, 이에 따라 산출된 세액에서 「소득세법」상의 세액공제 및 「조세특례제한법」상의 세액공제를 적용합니다. 이후 이미 원천징수하여 납부한 소득세를 공제한 차액을 원천징수하게 됩니다.
2. 납세조합 세액공제: 납세조합에 가입한 근로소득자는 납세조합을 통해 을종근로소득(예: RSU, ESPP 등)이 원천징수된 경우, 일정 금액을 납세조합 세액공제로 적용받을 수 있습니다. 이 공제액은 연말정산 시 산출세액에서 공제됩니다. 2019년 귀속분부터는 산출세액의 5%가 공제됩니다.
3. 원천징수영수증 확인: 납세조합으로부터 받은 원천징수영수증을 통해 이미 납부한 세액과 납세조합 세액공제액을 확인하고, 이를 연말정산 시 반영해야 합니다.