연말정산 시 고용보험료와 실제 급여에서 공제된 금액의 차이가 발생하는 구체적인 이유는 무엇인가요?
2026. 2. 13.
연말정산 시 국세청 간소화 서비스에서 제공하는 고용보험료와 실제 급여에서 공제된 금액이 다른 경우, 그 이유는 주로 다음과 같습니다.
- 보험료 납부 시점의 차이: 간소화 서비스는 보험료가 실제로 공단에 납부된 시점을 기준으로 반영됩니다. 따라서 12월 급여에서 공제된 고용보험료가 다음 해 1월에 납부되는 경우, 해당 연도의 간소화 자료에는 반영되지 않을 수 있습니다.
- 보수총액 정산으로 인한 추가 납부 또는 환급: 연말이 지나 실제 소득이 확정되면 건강보험공단 등에서 보험료 정산을 하게 됩니다. 이 과정에서 추가 납부 또는 환급이 발생할 수 있으며, 이로 인해 급여에서 원천공제된 금액과 최종 정산 금액에 차이가 발생할 수 있습니다.
- 회사 내부 집계 방식과 공단 반영 시점의 차이: 회사가 보험료를 집계하고 납부하는 방식과 공단에 반영되는 시점 사이에 시차가 발생할 수 있습니다. 또한, 여러 회사에서 근무한 경우 각 회사의 보험료 납부 내역이 합산되는 과정에서 차이가 발생하기도 합니다.
- 자격 취득 및 상실 시점의 차이: 근무 시작일과 4대 보험 자격 취득일이 다르거나, 중간에 자격 상실 및 재취득 이력이 있는 경우 간소화 자료 반영 시점에 영향을 줄 수 있습니다.
이러한 차이가 발생했을 경우, 연말정산 시에는 실제 급여에서 원천공제된 금액(실제 납부한 금액)을 기준으로 공제받으셔야 합니다. 간소화 서비스 자료는 참고용으로 활용하시고, 차이가 나는 부분은 회사에 문의하여 정확한 공제 금액을 확인하시는 것이 좋습니다.

정선화 변호사가 검증한 답변이에요.
변호사정선화법률사무소
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