복식부기 프로그램을 사용하실 때에는 몇 가지 주의사항이 있습니다. 첫째, 프로그램에서 제공하는 계정과목이 사업의 특성과 맞지 않을 경우, 임의로 수정하기보다는 세무 전문가와 상담하여 조정하는 것이 좋습니다. 둘째, 프로그램이 자동으로 수집하는 자료(홈택스, 카드 매출 등)가 누락되거나 오류가 없는지 주기적으로 확인해야 합니다. 셋째, 복식부기 의무자임에도 불구하고 프로그램 사용을 소홀히 하여 기장을 하지 않거나 부실하게 기장할 경우, 무신고 가산세나 무기장 가산세 등 불이익을 받을 수 있습니다. 넷째, 프로그램 사용만으로 모든 세무 문제가 해결되는 것은 아니므로, 절세 방안 마련이나 복잡한 세무 신고는 세무사의 도움을 받는 것을 고려해 보시는 것이 좋습니다. 특히 법인 전환 등 중요한 의사결정 시에는 사업장의 상황을 면밀히 고려해야 합니다.