추가 세금 납부: 연말정산 시 받을 수 있었던 각종 소득공제 및 세액공제 혜택을 받지 못해 더 많은 세금을 납부하게 됩니다. 예를 들어, 신용카드 사용액, 의료비, 교육비, 기부금 등에 대한 공제를 받지 못하면 환급받을 금액이 줄거나 추가 납부할 세금이 발생할 수 있습니다.
가산세 부과: 연말정산을 제대로 신고하지 않아 세금 부족분이 발생하면, 과소 신고 가산세 및 납부 지연 가산세가 부과될 수 있습니다. 이는 납부해야 할 세금 외에 추가적인 부담으로 작용합니다.
세금 환급 기회 상실: 정당하게 받을 수 있었던 세금 환급금을 받지 못하게 됩니다.
다만, 연말정산 기간이 지났더라도 5월 종합소득세 신고 기간에 누락된 공제 항목을 반영하여 수정 신고함으로써 일부 보완이 가능합니다. 수정 신고 시에는 신고 기한에 따라 가산세 감면율이 적용됩니다.