세금계산서와 카드 매출 중복으로 40만원이 발생했을 때, 매출전표에는 100만원으로 입력하고 신고서에는 중복분 40만원을 차감하여 60만원으로 기재하는 것이 괜찮은가요?

세금계산서와 신용카드 매출이 중복되어 40만원이 발생한 경우, 매출전표에는 실제 거래 금액인 100만원으로 입력하고, 부가가치세 신고서의 '신용카드매출전표등발행금액집계표'에서 중복분 40만원을 별도로 기재하여 관리하는 것이 원칙입니다.

질문자님께서 말씀하신 것처럼 총 금액에서 중복분을 직접 차감하여 60만원으로 신고하는 경우, 최종적으로 신고된 과세표준과 납부세액이 정확하다면 큰 문제가 발생하지 않을 수 있습니다. 그러나 국세청에서는 양식에 맞는 신고 방식을 권장하므로, 형식상 오류로 지적될 가능성이 있으며, 신고 내용이 정확하더라도 사유 확인 요청을 받을 수 있습니다.

따라서 향후에는 국세청 권장 방식인 '신용카드매출전표등발행금액집계표'의 중복분란에 해당 금액을 정확히 기재하여 신고하시는 것이 가장 안전합니다.