벤처기업 주식매수선택권 행사이익 납부특례를 적용받은 임직원의 연말정산은 어떻게 진행해야 하나요?

벤처기업 주식매수선택권 행사이익에 대해 납부특례를 적용받은 임직원은 연말정산 대상에서 제외되며, 반드시 종합소득세 확정신고를 통해 세금을 납부해야 합니다.

1. 연말정산 제외: 납부특례를 신청한 경우, 회사는 해당 행사이익에 대해 원천징수를 하지 않으므로 연말정산 시 해당 소득을 포함하여 정산할 수 없습니다. 따라서 임직원은 근로소득 연말정산과는 별도로 본인의 종합소득세를 직접 신고해야 합니다.
2. 종합소득세 확정신고: 주식매수선택권을 행사한 날이 속하는 과세기간의 종합소득세 확정신고 기간(다음 해 5월 1일~5월 31일)에 해당 행사이익을 포함하여 종합소득 과세표준을 신고해야 합니다.
3. 분할납부: 종합소득세 신고 시, 전체 소득세액 중 분할납부세액(행사이익 관련 소득세액의 5분의 4)을 제외한 나머지 금액을 우선 납부합니다. 이후 다음 4개 연도의 종합소득세 확정신고 시 분할납부세액의 4분의 1씩을 각각 나누어 납부하게 됩니다.

유의사항

• 납부특례를 신청했더라도 회사는 지급명세서 및 특례적용대상명세서를 관할 세무서에 제출해야 합니다.
• 임직원은 종합소득세 신고 시 특례적용신청서 사본을 관할 세무서장에게 제출해야 하므로 관련 서류를 미리 준비하시기 바랍니다.