수입계산서를 발급받은 경우 납부할 부가가치세가 없나요?

수입세금계산서를 발급받았다고 해서 납부할 부가가치세가 없는 것은 아니며, 수입 시 세관장으로부터 발급받은 수입세금계산서상의 부가가치세액은 매입세액으로 공제받을 수 있습니다.

수입 재화에 대한 부가가치세는 원칙적으로 재화를 수입하는 자가 세관장에게 납부해야 합니다. 이때 세관장은 수입하는 자에게 수입세금계산서를 발급하며, 사업자는 이 수입세금계산서에 기재된 부가가치세액을 부가가치세 신고 시 매출세액에서 공제받거나 환급받을 수 있습니다.

다만, 다음의 경우에는 납부 절차나 공제 여부가 달라질 수 있습니다.

• 부가가치세 납부유예: 중소·중견사업자가 요건을 갖추어 부가가치세 납부유예를 신청하고 승인받은 경우, 재화 수입 시 부가가치세 납부를 유예받고 추후 예정신고 또는 확정신고 시 정산하여 납부할 수 있습니다.
• 매입세액 공제 요건: 수입세금계산서상의 매입세액을 공제받기 위해서는 해당 재화가 사업과 관련하여 사용되었거나 사용할 목적으로 수입된 것이어야 합니다. 사업과 직접 관련이 없는 지출이나 면세사업 관련 매입세액 등은 공제되지 않습니다.
• 보관 의무: 발급받은 수입세금계산서는 거래사실이 속하는 과세기간에 대한 확정신고 기한 후 5년간 보존해야 합니다.

따라서 수입세금계산서는 매입세액 공제를 위한 증빙 자료일 뿐, 수입 시 발생하는 부가가치세 납부 의무 자체가 면제되는 것은 아님을 유의하시기 바랍니다.