750,000원 발급 후 1,500,000원으로 수정세금계산서를 발급한 상황에서, 추가로 -750,000원 수정세금계산서를 발행하여 정정해도 되나요?

이미 발급된 수정세금계산서의 내용이 실제 거래 사실과 다르다면, 추가적인 수정세금계산서 발급을 통해 정정하는 것이 가능합니다.

질문하신 상황처럼 당초 750,000원 세금계산서에 대해 1,500,000원짜리 수정세금계산서를 발급하여 총액이 2,250,000원으로 잘못 처리된 경우, 이를 바로잡기 위해 -750,000원(또는 상황에 따라 1,500,000원 취소 후 750,000원 재발급 등)의 수정세금계산서를 발급하여 최종 공급가액을 의도하신 1,500,000원으로 맞추는 것은 실무적으로 허용되는 정정 절차입니다.

수정세금계산서 발급 시 유의사항은 다음과 같습니다.

• 정정의 원리: 수정세금계산서는 당초 발급된 세금계산서의 내용을 취소하거나 증감분을 반영하는 것이므로, 잘못된 합계 금액을 실제 거래 금액으로 되돌리기 위한 추가 발급은 가능합니다.
• 발급 사유: 이미 발급된 수정세금계산서의 내용이 착오로 잘못 기재된 것이라면 '기재사항 착오정정' 사유를 활용하여 발급할 수 있습니다.
• 가산세 여부: 부가가치세법 시행령 제70조에 따른 적법한 사유와 절차에 따라 수정세금계산서를 발급하는 경우에는 세금계산서 발급 관련 가산세가 발생하지 않습니다. 다만, 이로 인해 부가가치세 신고 금액이 변경되어 과소신고가 발생하는 경우에는 신고·납부불성실 가산세가 별도로 적용될 수 있습니다.

이미 발급된 건이 전자세금계산서라면 삭제나 정정이 불가능하므로, 반드시 수정세금계산서 발급을 통해 거래 사실을 바로잡으시기 바랍니다. 만약 구체적인 발급 사유나 작성일자 적용이 모호하다면, 세무 대리인과 함께 실제 거래 증빙을 확인하여 정확한 사유 코드를 선택하시길 권장합니다.