육아휴직 후 미복직 퇴사 시 발생한 연차수당에 대해 소득세가 1만원 발생한다면, 연말정산 시 환급될 것을 고려하여 소득세를 공제하지 않아도 되나요?

연차수당 지급 시 발생하는 소득세는 원천징수 의무자가 반드시 징수하여 납부해야 하므로, 연말정산 시 환급 가능성이 있더라도 임의로 공제하지 않는 것은 불가능합니다.

원천징수는 소득을 지급하는 시점에 세법에 따라 정해진 세액을 징수하는 절차이며, 연말정산은 다음 연도 2월에 연간 총급여를 기준으로 정확한 세액을 다시 계산하여 기납부한 세액과 정산하는 과정입니다. 따라서 원천징수 시점에 세액이 발생한다면, 연말정산 결과 환급 여부와 관계없이 원천징수 의무자는 해당 세액을 공제하고 지급해야 합니다.

만약 이를 공제하지 않고 지급할 경우, 원천징수 의무 위반에 해당하여 가산세 등의 불이익이 발생할 수 있습니다. 연말정산 시 환급받는 금액은 정산 절차를 통해 근로자에게 돌려주게 되므로, 지급 시점에는 원칙대로 세금을 공제하고 지급하시기 바랍니다.