농업회사법인이 면세 사업을 영위하는 경우에도 농산물 밭 매입 시 발생하는 작업비(인건비, 식대 등)를 비용으로 처리할 수 있나요?

부가가치세가 면세인 농업회사법인도 재배 작업에 필요한 인건비·식대 등을 지출할 수 있고, 사업 관련 지출로 인정될 수 있습니다. 면세라는 이유만으로 비용 처리가 금지되는 것은 아닙니다.

다만 세금 처리는 부가가치세와 법인세를 나누어 보셔야 합니다.

• 법인세 장부 처리: 농산물 재배에 직접 들어간 인건비 등은 수확·판매 전까지 해당 농산물의 원가로 관리하고, 농산물을 판매할 때 비용으로 반영하는 방식이 적절할 수 있습니다. 지출 즉시 모두 당기 비용으로 처리되는 것은 아닙니다.
• 부가가치세 처리: 면세사업에 관련된 매입세액은 일반적으로 매출세액에서 공제받지 못합니다. 식대 등에 부가가치세가 포함되어 있더라도 그 세액을 공제할 수 있는지는 면세사업 관련 지출인지에 따라 따로 판단해야 합니다. 인건비 자체에는 통상 매입세액이 발생하지 않습니다.
• 증빙과 업무 관련성: 작업일지, 작업자·지급 내역, 영수증, 재배·수확 기록을 갖추고 실제 재배 작업과 연결되도록 보관하세요. 대표자 개인 식사나 사적 지출은 사업 비용으로 인정되지 않을 수 있습니다.

따라서 대표님께는 “면세 농업회사법인도 재배 작업비를 지출하고 비용으로 처리할 수 있지만, 직접 재배원가는 판매 전까지 농산물 원가로 관리하고, 면세사업 관련 매입 부가가치세는 별도 공제되지 않을 수 있다”고 설명하시면 됩니다.