공급가액을 처음부터 잘못 적은 것을 바로잡는 진짜 착오정정이라면, 요건을 갖춰 수정세금계산서를 발급하는 것만으로 세금계산서 관련 가산세가 생기지는 않습니다. 다만 세무조사 통지 등을 받아 세액이 고쳐질 것을 미리 안 경우에는 착오정정 방식의 수정 발급이 제한됩니다.
부가가치세법 시행령 제70조제1항제5호에 따라 당초 세금계산서를 음(-)으로 취소하고, 당초 작성일자를 유지해 올바른 공급가액으로 다시 발급합니다. 이때 당초 세금계산서의 작성일자는 실제 공급일에 맞아야 하고, 공급가액 오류가 단순 입력 착오 등으로 발생했다는 점도 거래자료로 설명할 수 있어야 합니다.
반대로 8월 발급 당시 금액은 맞았고 11월에 할인·계약변경 등으로 실제 공급가액이 달라진 것이라면 착오정정이 아닙니다. 이 경우에는 공급가액 증감 사유가 발생한 날을 작성일로 하는 수정세금계산서를 발급해야 하므로, 당초 작성일자를 그대로 두면 사유와 발급 방식이 맞지 않을 수 있습니다.
따라서 질문하신 방식은 8월 당시 금액 자체가 잘못 기재된 경우에 한해 적용할 수 있습니다. 적법한 착오정정 수정세금계산서의 발급 가산세와, 수정신고에 따른 추가 납부세액·신고 또는 납부 관련 가산세는 별개로 판단해야 합니다. 이미 알고 계신 수정신고를 하더라도, 세무조사 통지·현지 확인 착수·과세자료 해명안내 등으로 경정될 것을 미리 안 상태라면 수정 발급 가능 여부를 먼저 살펴보셔야 합니다.