회사에서 부담한 건강보험료는 근로자 본인이 낸 보험료가 아니므로 근로자 본인의 연말정산 보험료 공제로 청구할 수 없습니다. 근로자 급여에서 실제로 공제된 본인 부담분만 공제 대상입니다.
일반적인 직장가입자는 보수월액 건강보험료를 근로자와 사업주가 각각 절반씩 부담합니다. 회사 부담분은 회사가 납부하고, 근로자 부담분은 회사가 급여에서 공제해 납부합니다. 따라서 연말정산에서는 급여명세서 등에 표시된 근로자 부담분을 확인하시면 됩니다.
다만, 건강보험료 중 보수 외 소득에 대해 별도로 부과되는 보험료는 직장가입자가 전액 부담합니다. 이 경우에도 본인이 부담한 보험료인지 확인해 공제 여부를 처리하셔야 합니다. 사립학교 교원 등에는 부담 비율에 별도 예외가 있을 수 있습니다.