종합소득세 감면분 납세 불이행으로 인해 사업자 계좌 미등록 시 세무서의 환급금 반환 요구에 대처하기 위해서는, 먼저 해당 환급금 반환 요구의 근거와 정확한 금액을 확인해야 합니다. 만약 세무서의 요구가 정당하다면, 미납된 세금을 납부하여 문제를 해결해야 합니다. 만약 세무서의 요구에 이의가 있거나, 본인의 납세 의무가 이미 이행되었다고 판단되는 경우에는 관련 증빙 자료(납부 영수증, 감면 증빙 서류 등)를 갖추어 세무서에 소명하거나 이의를 제기할 수 있습니다. 필요한 경우 세무 전문가의 도움을 받아 정확한 절차를 진행하는 것이 좋습니다.