법인 대표이사가 개인 소유 토지에 법인이 주택을 건설하고 이를 법인에 매도할 때 발생하는 과세 문제는 다음과 같습니다:
대표이사(개인)의 양도소득세: 토지를 법인에 매도할 때 발생하는 양도차익에 대해 양도소득세가 부과됩니다.
법인의 취득세: 법인이 토지와 건물을 취득할 때 취득세를 납부해야 합니다.
부당행위계산부인: 특수관계인인 대표이사와 법인 간의 거래이므로, 시가와 거래가액의 차이가 크면 부당행위계산부인 규정이 적용될 수 있습니다.
법인세 문제: 법인이 주택을 건설하고 매입하는 과정에서 발생하는 비용과 수익에 대해 법인세 과세 문제가 발생할 수 있습니다.
이러한 거래는 복잡한 세무 문제를 야기할 수 있으므로, 전문가의 상담을 받는 것이 좋습니다.