정부 과제 수행 시 발생하는 비용의 계정과목 처리는 보조금의 성격에 따라 달라집니다.
운영 자금이나 수익과 관련된 보조금의 경우 '국고보조금(영업외수익)'으로 처리합니다. 반면, 자산 취득과 관련된 보조금은 해당 자산의 차감 계정으로 처리하며, 예를 들어 차량 구입 보조금이라면 '국고보조금(차량운반구 차감)'과 같이 표시합니다. 이 계정은 자산의 내용연수에 걸쳐 감가상각비와 상계 처리됩니다.
세무 조정 시에는 자산 관련 보조금을 익금으로 처리하지만, 일시상각충당금 또는 압축기장충당금 등을 설정하여 과세를 이연시킬 수 있습니다.