폐업한 법인이 2025년 12월 31일에 폐업하는 경우, 2025년 귀속 연말정산 시 합병법인을 현 근무지로, 피합병법인을 종전 근무지로 하여 신고할 때 발생할 수 있는 문제는 무엇인가요?

폐업한 법인이 2025년 12월 31일에 폐업하고, 합병법인을 현 근무지, 피합병법인을 종전 근무지로 하여 연말정산을 신고하는 경우, 다음과 같은 문제점이 발생할 수 있습니다.

결론적으로, 폐업한 법인의 경우 해당 법인이 직접 연말정산을 진행할 수 없으므로, 합병법인에서 종전 근무지의 근로소득을 합산하여 연말정산을 진행해야 합니다. 다만, 이 과정에서 몇 가지 유의사항이 있습니다.

근거:

1. 지급명세서 제출 문제: 폐업한 법인은 더 이상 지급명세서를 제출할 수 없습니다. 따라서 합병법인에서 폐업한 법인의 근로소득을 포함하여 지급명세서를 제출해야 하는데, 이 과정에서 폐업 법인의 정보가 누락되거나 오류가 발생할 경우 문제가 될 수 있습니다.
2. 원천징수영수증 발급: 폐업한 법인이 폐업 전에 연말정산을 완료하지 못했다면, 근로자는 종전 근무지에 대한 원천징수영수증을 발급받지 못할 수 있습니다. 이 경우 합병법인에서 이를 확인하고 처리해야 합니다.
3. 세무서 신고 오류 가능성: 합병법인에서 종전 근무지의 소득을 합산하여 신고할 때, 폐업 법인의 정보가 정확하게 반영되지 않으면 세무서 신고 시 오류가 발생할 수 있습니다. 이는 추후 세무 조사나 가산세 부과의 원인이 될 수 있습니다.
4. 근로자의 직접 신고: 만약 합병법인에서 종전 근무지의 소득을 제대로 합산하지 못하거나 관련 서류 처리에 문제가 발생한다면, 근로자 본인이 직접 종합소득세 확정신고를 해야 하는 번거로움이 발생할 수 있습니다.