인적공제 대상에서 제외될 경우, 연말정산 시 납세자 본인이 받을 수 있는 세액공제 혜택이 줄어들어 결과적으로 더 많은 세금을 납부하게 됩니다. 즉, 인적공제를 통해 받을 수 있었던 소득공제 또는 세액공제 혜택을 받지 못하게 되어 납세자의 세금 부담이 늘어나는 것이 주요 불이익입니다.
예를 들어, 부양가족으로 등록할 수 없는 소득이 있는 부모님이나, 나이 요건을 충족하지 못하는 자녀 등이 있다면 해당 부양가족에 대한 기본공제 및 추가공제(경로우대, 장애인, 부녀자 공제 등)를 받을 수 없습니다. 이로 인해 연말정산 시 납부해야 할 총 결정세액이 증가하게 됩니다.