2026년부터 연결납세를 최초로 적용할 때, 중간예납세액을 계산할 때 주의해야 할 유의사항은 무엇인가요?

2026년부터 연결납세방식을 최초로 적용하는 경우, 연결중간예납세액은 각 연결법인의 중간예납세액 합계액으로 계산하며, 각 연결법인은 직전 사업연도 산출세액 기준 또는 해당 중간예납기간 법인세액 기준 중 하나를 선택하여 계산할 수 있습니다.

연결중간예납 계산 시 유의사항

1. 연결법인별 계산 방법 선택: 연결납세방식을 처음 적용할 때는 각 연결법인이 법인세법 제63조의2에 따른 중간예납세액 계산 방법(직전 사업연도 산출세액 기준 또는 해당 중간예납기간 법인세액 기준)을 각각 선택하여 계산한 후, 그 합계액을 연결중간예납세액으로 합니다.
2. 공시대상기업집단 적용: 직전 사업연도 종료일 현재 「독점규제 및 공정거래에 관한 법률」에 따른 공시대상기업집단에 속하는 내국법인(일부 제외)은 원칙적으로 '해당 중간예납기간의 법인세액을 기준으로 하는 방법'을 의무적으로 적용해야 합니다.
3. 연결법인 추가 시: 연결납세 적용 중 연결법인이 추가된 경우, 기존 연결중간예납세액과 추가된 연결법인의 중간예납세액을 합산하여 계산합니다.
4. 휴업 등 수입금액 부재: 중간예납기간 중 휴업 등의 사유로 수입금액이 없는 법인에 대해 관할 세무서장이 사실을 확인한 경우, 해당 법인의 중간예납세액은 징수하지 않습니다.
5. 분납 규정: 연결중간예납세액이 1천만원을 초과하는 경우, 납부기한이 지난 날부터 1개월(중소기업은 2개월) 이내에 분납할 수 있습니다.

주의할 점

• 연결납세방식 적용 승인이 취소되는 경우, 이미 납부한 연결중간예납세액 중 각 연결법인별로 귀속된 금액은 해당 법인의 중간예납세액으로 보아 정산 절차를 거치게 됩니다.
• 연결법인별 산출세액 계산 시 토지등양도소득에 대한 법인세액 및 투자·상생협력 촉진을 위한 과세특례 법인세액 등이 포함될 수 있으므로, 각 연결법인의 세무 조정 사항을 정확히 반영해야 합니다.