기업 합병 시 근속기간이 통산되는 경우 연말정산은 어느 회사에서 진행하나요?

법인의 합병으로 인해 피합병법인의 임직원이 현실적인 퇴직 없이 합병법인에 고용이 승계된 경우, 해당 임직원에 대한 연말정산은 합병법인이 수행합니다.

합병 시 근속기간이 통산되는 상황에서의 연말정산 처리는 다음과 같습니다.

• 연말정산 주체: 피합병법인의 임직원이 합병법인으로 고용이 승계되어 계속 근무하는 경우, 합병법인이 해당 임직원의 연말정산을 실시합니다.
• 소득 합산: 합병법인은 피합병법인으로부터 해당 임직원의 근로소득원천징수영수증과 근로소득원천징수부 사본을 제출받아, 피합병법인에서 지급한 근로소득과 합병법인에서 지급한 근로소득을 합산하여 연말정산을 진행해야 합니다.
• 기납부세액 공제: 합산 시 피합병법인에서 이미 원천징수하여 납부한 세액은 기납부세액으로 공제하며, 이때 전 근무지(피합병법인)의 기납부세액은 해당 원천징수영수증상의 결정세액을 기준으로 합니다.
• 지급명세서 제출: 연말정산을 수행한 합병법인이 해당 임직원에 대한 근로소득 지급명세서를 제출할 의무를 가집니다.

만약 합병 시점에 퇴직금을 실제로 정산하여 지급하고 고용 관계가 단절된 후 재입사하는 형태라면 근속기간은 통산되지 않으며, 이 경우 각각의 법인에서 별도로 연말정산을 수행하게 됩니다.