신용카드 매출전표에 실제 공급자가 아닌 결제대행업체 상호만 기재된 경우 매입세액 공제는 어떻게 구분하나요?

신용카드 매출전표에 실제 공급자가 아닌 결제대행업체(PG사)의 상호만 기재된 경우, 해당 결제대행업체가 단순히 결제 대행 업무만을 수행하는 곳이라면 실제 재화나 용역을 공급한 사업자의 업종과 거래 사실을 확인하여 매입세액 공제 여부를 판단해야 합니다.

부가가치세법상 신용카드 매출전표를 통한 매입세액 공제는 재화를 공급한 사업자와 신용카드 매출전표를 발급하는 사업자가 동일한 경우에 원칙적으로 가능합니다. 다만, 결제대행업체를 통한 거래는 실무적으로 다음과 같이 구분하여 대응해야 합니다.

1. 공제 가능 여부 확인: 결제대행업체를 통한 결제라 하더라도, 실제 재화나 용역을 공급한 사업자가 매입세액 공제 대상(일반과세자 또는 공제 대상 간이과세자)이고, 해당 지출이 사업과 직접 관련이 있다면 매입세액 공제가 가능합니다.
2. 증빙 보완: 결제대행업체 상호만 기재되어 실제 공급자의 업종 확인이 어려운 경우, 국세청 전산에서 거래처 정보가 조회되지 않을 수 있습니다. 이 경우 납세자는 해당 홈페이지에서 물품 구입 내역 등을 조회하여 실제 공급자가 매입세액 공제 제외 업종(목욕·이발·미용업, 여객운송업, 입장권 발행 사업 등)이 아님을 입증해야 합니다.
3. 주의사항: 만약 온라인 중개 플랫폼(수탁자)이 실제 판매자(위탁자)의 물품을 판매 대행하면서, 위탁자가 아닌 수탁자 명의로 신용카드 매출전표를 발급하는 경우에는 매입세액 공제를 받을 수 없다는 예규가 있으므로 거래 형태를 명확히 구분해야 합니다.

따라서 단순히 결제대행업체 상호가 찍혀 있다는 이유만으로 공제 여부를 단정하지 말고, 실제 거래 상대방의 사업자 정보와 해당 지출의 사업 관련성을 반드시 확인하시기 바랍니다.