세금계산서 발행 금액이 매출처별 합계표와 일치하지 않는데, 전체 금액을 포함한 뒤 수입금액에서 제외하는 것이 맞나요?

세금계산서 발급 금액과 매출처별 세금계산서 합계표의 금액이 일치하지 않는 경우, 이를 임의로 수입금액에서 제외하여 신고하는 것은 불가능하며 가산세 부과 및 매입세액 불공제 등의 불이익이 발생할 수 있습니다.

부가가치세 신고 시 매출처별 세금계산서 합계표는 실제 발급한 세금계산서의 내역을 바탕으로 작성되어야 하며, 과세표준(수입금액) 또한 이와 일치해야 합니다. 만약 세금계산서가 사실과 다르게 과다하게 발급되었거나 기재사항에 오류가 있다면, 다음과 같은 절차를 통해 정정해야 합니다.

1. 수정세금계산서 발급: 필요적 기재사항이 착오로 잘못 적혔거나, 면세 등 발급 대상이 아닌 거래에 대해 발급한 경우 등 사유에 따라 수정세금계산서를 발급하여 당초 발급분을 취소하거나 정정해야 합니다.
2. 합계표 수정 제출: 수정세금계산서가 발급되면 해당 내역을 반영하여 매출처별 세금계산서 합계표를 다시 작성하여 신고해야 합니다.
3. 가산세 주의: 합계표의 기재사항 중 공급가액이 사실과 다르게 적힌 경우, 공급가액의 0.5%에 해당하는 가산세가 부과될 수 있습니다. 다만, 착오로 인한 경우로서 거래사실이 확인되는 등 예외적인 경우에는 가산세가 적용되지 않을 수 있습니다.

임의로 수입금액에서 제외하는 행위는 과세표준 누락으로 간주되어 세무조사나 경정의 대상이 될 수 있으므로, 반드시 실제 거래 사실에 부합하도록 세금계산서를 수정하고 그에 맞춰 합계표를 제출하시기 바랍니다.