본점과 지점 간 자금 이체 시 발생하는 부가가치세는 어떻게 처리되나요?

사업장이 둘 이상인 사업자가 본점과 지점 간에 재화를 반출하는 경우, 원칙적으로는 재화의 공급으로 보아 부가가치세가 과세되나 주사업장 총괄납부 또는 사업자 단위 과세를 적용받는 경우에는 재화의 공급으로 보지 않습니다.

1. 재화의 공급으로 보지 않는 경우 (특례)

다음 중 하나에 해당하는 과세기간에 자기의 다른 사업장으로 재화를 반출하는 경우에는 재화의 공급으로 보지 않아 세금계산서 발급 의무가 없습니다.

• 사업자 단위 과세 사업자: 본점 또는 주사무소에서 사업자등록을 하고 신고·납부하는 사업자
• 주사업장 총괄 납부 사업자: 주된 사업장에서 각 사업장의 납부세액 또는 환급세액을 총괄하여 납부하는 사업자

2. 재화의 공급으로 보는 경우 (원칙)

위의 특례를 적용받지 않는 일반적인 사업자가 본점과 지점 간에 재화를 반출하는 경우에는 재화의 공급으로 보아 세금계산서를 발급하고 부가가치세를 신고·납부해야 합니다. 다만, 이 경우에도 실질적인 소유권 이전이 없는 내부거래이므로 세금계산서 발급 시 공급가액을 시가로 할지 원가로 할지 등은 거래 형태에 따라 달라질 수 있습니다.

3. 자금 이체 거래의 경우

본점과 지점 간에 단순히 자금을 이체하는 거래는 재화나 용역의 공급에 해당하지 않으므로 부가가치세 과세 대상이 아니며 세금계산서 발급 대상도 아닙니다.

유의사항

• 주사업장 총괄 납부를 신청하려는 경우, 납부하려는 과세기간 개시 20일 전까지 관할 세무서장에게 신청서를 제출해야 합니다.
• 사업자 단위 과세를 적용받으려면 본점 또는 주사무소 관할 세무서장에게 등록을 신청해야 합니다.
• 본점과 지점 간의 자금 거래는 부가가치세와는 무관하지만, 외국법인 국내지점의 경우 법인세법상 '간주자본 지급이자' 계산 등 별도의 세무 조정이 필요할 수 있으므로 주의가 필요합니다.