의료비 지출액에서 보험금으로 보전받은 금액은 어떻게 처리되나요?

의료비 세액공제 대상 금액을 계산할 때, 보험회사 등으로부터 지급받은 실손의료보험금 등 보험금으로 보전받은 금액은 공제 대상 의료비에서 제외(차감)합니다. 즉, 실제로 본인이 부담한 의료비만 의료비 세액공제 대상이 됩니다.

처리 방식

• 의료비 지출액에서 실손의료보험금 등으로 보전받은 금액을 뺀 금액을 기준으로 의료비 세액공제를 적용합니다.
• 의료비 세액공제는 의료비를 지출한 과세기간에 공제하는 것이 원칙이므로, 지출 시점과 보험금 수령 시점이 다르더라도 지출한 연도의 의료비에서 해당 보험금을 차감해야 합니다.
• 예를 들어 2024년에 지출한 의료비의 실손의료보험금을 2025년에 수령한 경우, 2024년 귀속 연말정산 시 의료비 지급액에서 실손의료보험금 수령액을 차감하여 수정합니다.

공제 대상에서 제외되는 의료비 예시

• 보험회사 등으로부터 지급받은 실손의료보험금
• 건강보험공단으로부터 지급받은 본인부담상한제 사후환급금
• 사내근로복지기금 등에서 보전받은 의료비
• 미용·성형수술비 및 건강증진을 위한 의약품 구입비
• 외국 소재 의료기관에 지출한 비용

제출 서류 및 유의사항

• 의료비 지급명세서와 의료기관·약국이 발행한 계산서·영수증 또는 진료비(약제비) 납입확인서 등을 제출해야 합니다.
• 홈택스에서 제공되는 의료비 증명서류에 본인부담이 아닌 금액, 입사 전 지출금액 등 공제 대상이 아닌 지출액이 포함되어 있으면 그 금액을 차감하고 공제 신청해야 합니다.
• 의료기관 등이 국세청에 자료를 제출하지 않았거나 본인이 자료 제출을 거부한 경우 등에는 해당 기관에서 직접 발급한 의료비 영수증을 첨부해야 합니다.

관련 규정

• 소득세법 제59조의4 제2항(특별세액공제 중 의료비)
• 소득세법 시행령 제118조의5 제1항(공제 대상 의료비 범위, 실손의료보험금 제외)
• 소득세법 시행령 제118조의5 제2항(미용·성형수술비 및 건강증진 의약품 구입비 제외)

보험금 수령 시점과 의료비 지출 시점이 달라 수정신고가 필요한 경우, 일정 요건 하에 가산세가 면제될 수 있으므로 관련 적용 요건을 확인해 보시는 것이 좋습니다.