주택 1채와 상가 1채를 보유한 경우, 주택 1채에서 발생하는 임대 수입은 원칙적으로 종합소득세 신고 대상이 아닙니다. 다만, 그 주택이 기준시가 12억원을 초과하는 고가주택이거나 국외에 소재하는 주택이라면 1주택이더라도 월세 수입은 과세 대상이 됩니다.
따라서 질문하신 상황처럼 국내 기준시가 12억원 이하인 주택 1채와 상가 1채만 있고, 주택에서는 월세 수입만 있다면 주택 임대 수입은 비과세에 해당합니다. 다만 상가의 임대 수입은 별도로 과세 여부를 확인해야 하고, 고가주택이나 국외주택에 해당하면 주택 1채라도 과세될 수 있습니다.