두 직장에서 같은 소득·세액공제 항목을 중복 반영했다면, 해당 과세연도의 근로소득을 합산해 연말정산하면서 중복분을 제외하거나 이미 정산·신고했다면 신고 단계에 맞춰 수정해야 합니다.
아직 연말정산 전이라면 주된 근무지에 두 직장의 근로소득을 합산해 정산하도록 하고, 중복으로 신청한 공제 항목을 바로잡은 소득·세액 공제신고서와 증빙자료를 제출하세요. 여러 직장에서 근로소득을 받는 경우 주된 근무지에서 근로소득을 합산해 정산하는 방식이 원칙입니다. 공제는 해당 항목의 요건과 한도에 맞게 반영해야 하며, 같은 지출이나 같은 부양가족을 두 번 공제받아서는 안 됩니다.
연말정산은 끝났지만 종합소득세 확정신고 전이라면 중복 공제를 제거한 내용으로 종합소득세 신고를 해 실제 납부할 세액을 바로잡을 수 있습니다. 이미 확정신고까지 마쳤다면 과다 공제한 내용을 수정신고하고 부족한 세액을 추가 납부하는 절차를 검토해야 합니다. 과다 공제로 세금을 덜 낸 경우에는 추가 세액 외에 가산세가 발생할 수 있습니다. 가산세는 누락 경위와 납부 시점 등에 따라 달라지므로 실제 신고 내용에 맞춰 확인해야 합니다.
중복 여부는 공제 항목별로 살펴보세요. 예를 들어 부양가족을 두 직장에서 각각 공제했거나, 같은 지출을 양쪽 회사에 제출해 공제받았다면 중복 반영 여부를 확인해야 합니다. 반면 두 직장에서 받은 급여 자체는 합산 정산 대상이므로, 공제 항목을 무조건 한 회사에만 입력하는 것으로 끝나는 것은 아닙니다. 이미 제출한 원천징수영수증과 공제신고서, 두 직장의 정산 내역을 대조해 중복분을 가려내는 것이 우선입니다.
두 곳에서 동시에 근무한 경우와 과세기간 중 한 직장에서 퇴직한 뒤 다른 직장에 취업한 경우는 정산 절차가 다를 수 있습니다. 후자의 경우에는 종전 직장 소득을 새 직장 연말정산에 포함했는지도 확인하세요.