화물자동차 운송사업 허가 시 발생하는 주요 세금은 등록면허세입니다. 등록면허세는 면허를 부여받거나 변경할 때 납부해야 하며, 면허 부여기관은 등록면허세 납부 여부를 확인한 후 면허증서를 발급합니다.