사업용 계좌 사용·신고 의무를 지키지 않으면 가산세 부과, 조세특례제한법상 감면 배제, 과세표준·세액 경정사유 해당이라는 불이익이 발생할 수 있습니다. 다만 질문하신 ‘입금 내역 누락’이 사업용계좌 미사용인지, 수입금액 신고 누락인지에 따라 적용되는 제재가 달라지므로 구분해서 보셔야 합니다.
현재 질문만으로는 입금 내역 누락이 사업용계좌 미사용·미신고 문제인지, 수입금액 신고 누락 문제인지 단정하기 어렵습니다. 실제 과세기간, 사업자 유형, 누락 금액과 경위 등을 기준으로 구체적으로 확인해 보시는 것이 좋습니다.