전자식 온누리상품권과 종이 온누리상품권은 상품권 형태만으로 부가가치세 처리가 달라지지 않습니다. 상품권을 살 때와 상품권으로 실제 물건·용역을 살 때를 구분해야 합니다.
따라서 전자식 상품권은 결제내역을 확인하기 편할 수 있지만, 전자식이라는 이유만으로 매입세액 공제 대상이 되거나 종이 상품권과 다른 부가가치세가 적용되는 것은 아닙니다. 사업용으로 실제 구매한 경우에는 가맹점이 발급한 증빙과 물품·용역의 사업 관련성을 함께 보관해 두시는 것이 좋습니다. 과세·면세 겸영, 개인 사용, 공제 불가 지출 등에서는 공제 여부가 달라질 수 있습니다.
「부가가치세법」 제38조는 사업을 위해 공급받은 재화·용역의 매입세액을 공제하도록 하고, 제39조는 세금계산서 미수취 등 일정한 매입세액을 공제하지 않도록 정합니다. 구체적인 결제수단별 증빙 인정 여부는 실제 발급된 자료와 거래 방식에 따라 확인해야 합니다.