근로소득자가 종합소득세를 신고하더라도 사업주(회사)가 부담한 건강보험료·국민연금 보험료는 근로자 본인의 필요경비나 소득공제로 처리할 수 없습니다. 근로자 본인이 부담한 금액과 사업주 부담분을 구분하셔야 합니다.
따라서 급여명세서나 연말정산 자료에 표시된 근로자 부담분만 본인의 공제 대상으로 반영하고, 사업주 부담분을 추가로 넣어 중복 공제하지 않으시면 됩니다. 종합소득세 신고를 하더라도 이 구분은 달라지지 않습니다. 소득세법상 사업주가 부담한 보험료를 필요경비로 처리하는 규정은 사업소득을 계산하는 사업자에게 적용되는 것이며, 근로소득자의 공제와는 별개입니다.