부가가치세는 건설공사의 간접비 항목에 포함되는 비용이 아니라, 과세 대상 공급가액에 별도로 계산하는 세금입니다.
부가가치세법상 공급가액은 부가가치세를 제외한 금액이며, 매출세액은 그 과세표준에 세율을 적용해 계산합니다(부가가치세법 제29조제3항, 제37조제1항). 따라서 공사원가나 간접비를 산정할 때 부가세를 간접비 항목에 넣기보다는, 과세 여부와 공급가액을 확인한 뒤 세액을 별도 표시하는 방식으로 구분하시면 됩니다.
다만 견적서나 계약서에 부가세 포함 총액으로 금액이 정해졌다면, 총액 자체와 그 안에 포함된 부가세를 구분해 표시해야 합니다. 부가세 포함 여부가 분명하지 않은 대가라면 공급가액은 받은 금액에 100분의 100을 110으로 나눈 비율을 곱해 계산합니다(부가가치세법 제29조제7항).