법인이 여행사 사이트에서 항공권을 예약할 때 발생하는 취급수수료에 대해 부가세 매입세액 공제가 가능한가요?

항공권 운임과 별도로 청구된 취급수수료는 여행사의 예약·발권 대행용역 대가라면, 사업 관련성과 적격 증빙 등 요건을 갖춘 경우 매입세액 공제가 가능할 수 있습니다. 항공권 운임과 달리 수수료라는 이름만으로 공제 여부가 결정되지는 않습니다.

확인하실 기준은 다음과 같습니다.

• 법인의 과세사업과 관련된 예약인지 확인하세요. 임직원의 업무 출장처럼 과세사업에 쓰인 지출이어야 하며, 개인 용도나 면세사업 관련 지출이면 공제되지 않을 수 있습니다.
• 누가 수수료를 공급했는지 확인하세요. 영수증이나 세금계산서에서 여행사가 공급자로 표시되어 있고, 실제로 여행사가 별도의 대행용역을 제공한 거래인지 살펴보셔야 합니다.
• 세금계산서를 받았다면 필요적 기재사항이 맞는지 확인하세요. 신용카드매출전표로 공제받으려면 공급자가 관련 요건을 갖춘 사업자여야 하고, 부가가치세액이 별도로 구분 표시되어야 하며 수령명세서 제출 및 증빙 보관 요건도 갖춰야 합니다.
• 카드전표에 수수료 금액만 표시되고 부가가치세가 따로 표시되지 않거나, 항공사 운임과 구분되지 않는다면 그 자료만으로 수수료에 포함된 부가가치세를 공제하기 어렵습니다. 가능하면 여행사 명의의 세금계산서 또는 수수료와 부가가치세가 구분된 적격 카드전표를 확인하세요.

부가가치세법 제38조는 사업에 사용하거나 사용할 목적으로 공급받은 재화·용역의 매입세액을 공제하도록 하지만, 제39조는 세금계산서 미수취·필요적 기재사항 오류, 사업과 직접 관련 없는 지출 등은 공제하지 않도록 정합니다. 신용카드전표를 이용하는 경우에도 별도의 요건이 적용됩니다.

따라서 법인 출장 등 과세사업 관련 수수료이고, 여행사가 공급한 과세 용역임을 확인할 수 있는 적격 증빙에 부가가치세가 구분되어 있다면 공제 가능성이 있습니다. 항공권 운임과 수수료가 한 장의 영수증에 함께 있더라도 항목별 공급자와 세액 표시를 나누어 확인해 처리하시는 것이 안전합니다.