영업권 평가에서 자기자본은 평가기준일 현재 해당 사업과 관련된 자산가액에서 부채가액을 뺀 금액을 기준으로 합니다. 비상장법인은 순자산가액 계산 방식에 따라 산정하며, 영업권을 평가할 때는 이번에 계산하는 영업권 자체를 자기자본에 포함하지 않습니다.
따라서 재무상태표의 자본총계나 장부상 금액을 그대로 쓰기보다는, 평가기준일 현재 자산과 부채를 세법상 평가한 금액으로 확인하는 것이 중요합니다. 개인사업자처럼 자기자본을 확인할 수 없는 경우에는 증빙으로 확인할 수 없다는 사정을 전제로, 다음 두 금액 중 더 큰 금액을 자기자본으로 사용합니다.
이때 자기자본이익률과 자기자본회전율은 업종·규모별 기준을 적용하므로, 임의의 비율을 넣어 계산하면 안 됩니다. 실제 평가에서는 평가기준일의 자산·부채 명세와 자기자본 증빙을 먼저 정리하고, 확인이 어려운 경우 적용할 해당 업종·규모의 비율을 세무사와 검토하시는 것이 좋습니다.